Schema for Iso-Seq Read Alignments - Minimap2 Alignments of D. grimshawi Iso-Seq Reads
  Database: DgriCAF1    Primary Table: isoseq_bam_adult_males_rep2
BAM File: /gbdb/DgriCAF1/bbi/isoseq/DgriCAF1_SRR6840923.bam
Format description: The fields of a SAM short read alignment, the text version of BAM.
See the SAM Format Specification for more details
fielddescription
qNameQuery template name - name of a read
flagFlags. 0x10 set for reverse complement. See SAM docs for others.
rNameReference sequence name (often a chromosome)
pos1 based position
mapQMapping quality 0-255, 255 is best
cigarCIGAR encoded alignment string.
rNextRef sequence for next (mate) read. '=' if same as rName, '*' if no mate
pNextPosition (1-based) of next (mate) sequence. May be -1 or 0 if no mate
tLenSize of DNA template for mated pairs. -size for one of mate pairs
seqQuery template sequence
qualASCII of Phred-scaled base QUALity+33. Just '*' if no quality scores
tagTypeValsTab-delimited list of tag:type:value optional extra fields

Sample Rows
 
qNameflagrNameposmapQcigarrNextpNexttLenseqqualtagTypeVals
SRR6840923.561550scaffold_15160982057M70N356M23S*00AATTAGAACATATTTGGAAGTGCTATAGTAAATCCACAAATCAAAATGAAAGTGTTGATCGTCTTATTTGCTCTGATTGCCATTGCATTGGCTAGTGGAGGTTATAATGCACAGCAAGGACATGGTGGACATGGCCAGGCTGGATTTGGCCAAGGTGGACATGGCCAGGCTGGATTTGGCCAAGGTGGACATGGCCAGGCTGGACATGGCCAGGCTGGACTTGGCGGACATGGATCGCACGGCCAATCTGGATTTGGCCAGGGTGGACATGGCCATGCTGGACTTCACGATGGTGGACGTGGCCATGGTGCACATGGTGGACAAGGTGGCCATGGTAGCCATGGTGGTCGCGGTGGCCACTATTAGCCTATTTAAATCAATAAAGATAGGAAGTTTTTGAGCCTAACCCCAACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:3 ms:S:398 AS:S:374 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:C:126 s1:S:391 s2:S:382 de:f:0.0073 rl:C:24
SRR6840923.562410scaffold_187103393M66N240M23S*00ATCAGTATAATTGTTGAGGTTTGCATTGCAACTATTCGAAAATGAAGTGGCTGTCAATTGCATTTGTGTTGGGTCTGTTGGCTTTTGCTAGTGCCGATCCCTTAAGGGGTGGTGACGTCATCATTAACGGACATTGTGTTAGCTGCAATGTTCATGGAGGCTAAGGACTGAAGAACTAAACTGAAGAATGCCAAACAGCACACAAACTACACATTATTTAGATTCCGTAATTGAAATGGAAACTTATCAAATGAGATTCTAGAAGCAATGATTGCAGCCAAATCGCATTTGTCTTATGCACAGTAAATATAATAAATACACATTTAATACATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:0 ms:S:333 AS:S:309 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:C:100 s1:S:322 s2:S:310 de:f:0 rl:C:24
SRR6840923.561450scaffold_1084425060698M19S*00AACTTCAATGGAGAGATATTCAGCATGAAGCAAAAGGATGAAAAGCCCGGCTCTGTGAATGGATTAATCTTTTCCACCAAGCATAAAGAAGAAAAACCTGCAAGCTTCAATGGAGAGATATTCTGTAGCAAGCAAAAAGAAGAGAAGCCTGCTAACTTCAATGGAGAGATATTCTGCATGAAGCAAAAGGATGAAAAGCCCGGCTCTGTGAATGGATTAATCTTTTCCACCAAGCATAAAGAAGAAAAACCTGCAAGCTTCAATGGAGAAACATTCTGTAGTAAGCAAAAGGAAGAGAAGCCTGCTAACTTCAATGGAGAGATATTCTGCATGAAGCAAAAGGATGAAAAGCCCGGCTCTGTGAATGGATTAATCTTTTCCACCAAGCATAAAGAAGAAAAACCTGCAAGCTTCAATGGAGAGATATTCTGTAGCAAGCAAAAAGAAGAGAAGCCTGCTAACTTCAATGGAGAGATATTCTGCATGAAGCAAAAGGATGAAAAGCCCGGCTCTGTGAATGGATTAATCTTTTCCACCAAGCATAAAGAAGAAAAACCTGCAAGCTTCAATGGAGAGATATTCTGTAGCAAGCAAAAAGAAGAAAAACCTGCAAGCTTCAATGGAGAGATATTCTGTAGTAAGCAAAAAGAAGAGAAGCCTTCTAATTTCAATGGAGAGATATTCTGCATGAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:0 ms:S:698 AS:S:698 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:C:210 s1:S:694 s2:S:625 de:f:0 rl:C:27
SRR6840923.5605616scaffold_240616042S109M1I72M49I654M1D608M204I87M*00TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTACTCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAAATTAGAAGGCTTCTCTTCTTTTTGCTTACTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCTTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTACTACAGAATGTTTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCTTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAACTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCTGAATATCTCTCCATTGAAGTTGGCAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTACTACAGAATGTTTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGAAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTACTACAGAATATTTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACGGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAATTGGCAGGCTTCTCTTCTTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAACATCTCTCCATTGAAATTGGCAGGCTTCTCTTCTTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGCTTTTCTTCTTTGTGCTTGGTGGAATGGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAACATCTCTCCATTGAAGTTAGCTGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTACTACAGAATATTTCTCCATTGAAATTAGCAGGCTTCTCTTCTTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCT<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:S:271 ms:S:1329 AS:S:1357 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:S:427 s1:S:1427 s2:S:1191 de:f:0.013 rl:C:27
SRR6840923.5605416scaffold_24061305820S1128M*00TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTGTGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCTTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTACTACAGAATGTTTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCTTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCTGAATATCTCTCCATTGAAGTTGGCAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTACTACAGAATGTTTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGAAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTACTACAGAATATTTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACGGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATG<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:2 ms:S:1118 AS:S:1118 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:S:341 s1:S:1108 s2:S:871 de:f:0.0018 rl:C:29
SRR6840923.5605516scaffold_24061306014S931M*00TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCTTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTACTACAGAATGTTTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCTTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAACTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCTGAATATCTCTCCATTGAAGTTGGCAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTACTACAGAATGTTTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGAAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTACTA<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:2 ms:S:921 AS:S:921 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:S:276 s1:S:916 s2:S:835 de:f:0.0021 rl:C:23
SRR6840923.557772064scaffold_24061816021H1462M902H*00TTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCTTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTACTACAGAATGTTTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCTTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCTGAATATCTCTCCATTGAAGTTGGCAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTACTACAGAATGTTTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGAAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTACTACAGAATATTTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACGGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAGTTAGCAGGCTTCTCTTCCTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAATATCTCTCCATTGAAATTGGCAGGCTTCTCTTCTTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGTTTTTCTTCTTTATGCTTGGTGGAAAAGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAACATCTCTCCATTGAAATTGGCAGGCTTCTCTTCTTTTTGCTTGCTACAGAATATCTCTCCATTGAAGCTTGCAGGCTTTTCTTCTTTGTGCTTGGTGGAATGGATTAATCCATTCACAGAGCCGGGCTTTTCATCCTTTTGCTTCATGCAGAACATCTCTCCATTGAAG<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:3 ms:S:1447 AS:S:1447 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:S:414 s1:S:1356 s2:C:0 de:f:0.0021 SA:Z:scaffold_3063,2305,-,633S1752M203D,46,24; rl:C:45
SRR6840923.556442048scaffold_15141167660124M1890H*00ACTTTACATTATTATTGCGAATGGTAAAGTCCGTTTAATAGCTAAATTTGAAGTTTGCACAATTCTCAACACTTCTTAGAGTTTCGAAAGCGCTGTAAATGAAAATCAAAGCTGTGAATTTAAT<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:0 ms:C:124 AS:C:124 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:C:32 s1:C:118 s2:C:0 de:f:0 SA:Z:scaffold_14822,824408,+,152S1832M2290D30S,60,0; rl:C:31
SRR6840923.556452048scaffold_15141167660124M1972H*00ACTTTACATTATTATTGCGAATGGTAAAGTCCGTTTAATAGCTAAATTTGAAGTTTGCACAATTCTCAACACTTCTTAGAGTTTCGAAAGCGCTGTAAATGAAAATCAAAGCTGTGAATTTAAT<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:0 ms:C:124 AS:C:124 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:C:32 s1:C:118 s2:C:0 de:f:0 SA:Z:scaffold_14822,824408,+,152S1915M2204D29S,60,29; rl:C:30
SRR6840923.345882048scaffold_277917736014H125M3195H*00CAACAGTCTATTGAAGAGCAGAAGTTGGACACAAAGCAAAAGAAAATGTCTGAAAAGGATGCTGAAAAGAAGGCCCAGAAGGGTGAAGTATCTGAAGTTGTTGCTGAGAAAGTATCTGAAGAAAA<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:1 ms:C:120 AS:C:120 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:C:29 s1:C:116 s2:C:45 de:f:0.008 SA:Z:scaffold_15245,16813740,-,24S2566M922D744S,23,203; rl:C:30

Iso-Seq Read Alignments (isoseq_bam) Track Description
 

Description

This track shows the alignments of D. grimshawi Iso-Seq reads against the D. grimshawi genome assembly (DgriCAF1) using Minimap2. The Iso-Seq data were obtained from the NCBI Sequence Read Archive under the accession number SRP135764.

References

Yang H, Jaime M, Polihronakis M, et al. Re-annotation of eight Drosophila genomes. Life Sci Alliance. 2018;1(6):e201800156. Published 2018 Dec 24. doi:10.26508/lsa.201800156

Li H. Minimap2: pairwise alignment for nucleotide sequences. Bioinformatics. 2018;34(18):3094-3100. doi:10.1093/bioinformatics/bty191