Schema for Iso-Seq Read Alignments - Minimap2 Alignments of D. grimshawi Iso-Seq Reads
  Database: DgriCAF1    Primary Table: isoseq_bam_adult_females_rep1
BAM File: /gbdb/DgriCAF1/bbi/isoseq/DgriCAF1_SRR6840922.bam
Format description: The fields of a SAM short read alignment, the text version of BAM.
See the SAM Format Specification for more details
fielddescription
qNameQuery template name - name of a read
flagFlags. 0x10 set for reverse complement. See SAM docs for others.
rNameReference sequence name (often a chromosome)
pos1 based position
mapQMapping quality 0-255, 255 is best
cigarCIGAR encoded alignment string.
rNextRef sequence for next (mate) read. '=' if same as rName, '*' if no mate
pNextPosition (1-based) of next (mate) sequence. May be -1 or 0 if no mate
tLenSize of DNA template for mated pairs. -size for one of mate pairs
seqQuery template sequence
qualASCII of Phred-scaled base QUALity+33. Just '*' if no quality scores
tagTypeValsTab-delimited list of tag:type:value optional extra fields

Sample Rows
 
qNameflagrNameposmapQcigarrNextpNexttLenseqqualtagTypeVals
SRR6840922.886490scaffold_209711530253M64N4M1D370M21S*00CGATGATGAGTCTGAAGAAGAGACTGCGGCGCAGGAGGAGGAGGAGGATGCCGTGGAGCAGGAGCTGCTCGATGCGCAACTGCAGCGCGCCTATCAGGAGGAGACGGCCGAATACAAGAAGTATGGCGGTGCCGATGGCGTCAACGAAGATGAAGAAGACTCTGACGATGAGCAGTTGTATGAAGACGAGGACGAAAGCGATGACGATGAGGAAGAAGAGCTCGATGAAAAGGCACAGCGACTGCTCGAGGAGAAGCAAAAATGTCCGTGCAGTCGGACAAGGTGCACAAGGTGAACAAGCGGCAGGTGCACAAGGCGGAGGTCGATGAGCATCGGCTGCAGGCGCGCATGGTTAAGCCGCGTCATCGCAATCTCTTCCGCAAGCTGATACGCGAGAAACAGAGCAAGGAGAAGGAGGAGTGGCTGCTGCGCAAGAAGCGACGCAACATCGACACCGATGCCAAAGAGCAGAAAAAGACGGCCAAGCGGGATGCGCGCAAGGCGGCTGCCGCCGCTGCTGCGGCTGCTGCTCAGTTGGGCGCCAAGTGAACGCCGATATCGCTTATCCTGTGTCTTGATCTTAGGCTTAGTTTGTACACAAAAACAATAAAAGAAAACGAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:3 ms:S:610 AS:S:586 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:C:198 s1:S:596 s2:S:570 de:f:0.0048 rl:C:42
SRR6840922.882640scaffold_151601096046M70N560M13D173M65S*00ATTTGGAAGTGCTACAGTAAATCCACAAATCAAAATGAAAGTGTTGATCGTCTTATTTGCTCTGATTGCCATTGCATTGGCTAGTGGAGGCTATAATGCACAGCAAGGACATGGTGGACATGGCCAGGCTGGATTTGGCCAAGGTGGACATGGCCAGGCTGGATTTGGCCAAGGTGGACATGGCCAGGCTGGACATGGCCAGGCTGGACTTGGCGGACATGGATCGCACGGCCAATCTGGATTTGGCCAGGGTGGACATGGCCATGCTGGACTTCACGATGGTGGACGTGGCCATGGTGCACATGGTGGACAAGGTGGCCATGGTAGCCATGGTGGTCGCGGTGGCCACTATTAGCCTATTTAAATCAATAAAGATAGGAAGTTTTTGAGCCTAACCCCAACAATTTGAATTATTTTTAATTTTGCTAAAGTTTGTGAAGACAATCTATGGAATTCCTGGTTGCGAGTAGAAAGCTGCGATTAGTCTGATCTTGGATTTGGATAGACACATAATATTGGAGTGCAGTTGTCACTTGAAGAAGTAAGAGACGTAAAGCAACTTGGAGCGTATTTCCACTGATGAGTATTTCGAGACGTTTGCTAAATTTTCTCCCTGGCATCATTATGATTGGCAACTTTTAGTTATTGGTATATTTTTGTTTTTGTGCAACTAAACCACACACACATACACGCACACTCAAAGTAAGTGTGATTTTATTATCTGGCATATGAAATAAAGCTTTACGTTTAGCGATGCTTTCAGGGTTATCAGGGAATATACATATATATGAATATATGAATATATGTACATGTTTGTTAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:28 ms:S:685 AS:S:661 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:C:187 s1:S:665 s2:S:567 de:f:0.0205 rl:C:63
SRR6840922.886580scaffold_18796094M66N337M27S*00AATCAGTATAATTGTTGAGGTTTGCATTGCAACTATTCGAAAATGAAGTGGCTGTCAATTGCATTTGTGTTGGGTCTGTTGGCTTTTGCTAGTGCCGATCCCTTAAGGGGTGGTGACGTCATCATTAACGGACATTGTGTTAGCTGCAATGTTCATGGAGGCTAAGGACTGAAGAACTAAACTGAAGAATGCCAAACAGCACACAAACTACACATTATTTAGATTCCGTAATTGAAATGGAAACTTATCAAATGAGATTCTAGAAGCAATGATTGCAGCCAAATCGCATTTGTCTTATGCACAGTAAATATAATAAATACACATTTAATACATTGATCAATCACTTGTTATTCATTATCAAATTCTGCCACTGTAAATACTGTAAACACTGACCAATTGACGAGTATGTAACAGACCGTGACAGGTTGCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:0 ms:S:431 AS:S:407 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:C:131 s1:S:418 s2:S:389 de:f:0 rl:C:29
SRR6840922.885700scaffold_1528329605S235M1I362M30D41M1I357M3I130M26S*00ATGTGTTTCTAGATTAAGATTTTAATATTAAAAACCAAACAAAAGCAGAGAATTCAATGTGTGTAGCTGTGTGTTTAACTTTAGTTTAGTATATTAAACAATTACAACAACAAAATGACACTTAACAATTGGCATAAATGCATAATTCATCAATAAGCATGTTTACTATATACATATATATATATTATATATATACTGTGTGGCAGCTGGGTGTTTGTGTTAATATGAGTAAAATCGGCTAAAAAAAAAACTGATCAAGAAATTGACAATTTTGGGCAAATAATGAAAATGTTTGGGGAAAAAAAAACGAAAGAAATCTATAAAGTCATCTGTGTTAATAAATTTTAAAATAATTTATAGTGTAGCATAACTAAACAAAAACTGAAAACAAATTTCAAATCTAACAAATTGTAAAATGCCGATTGTAACATTTTTTTTTTTATATAGAGCTGCAACAAAAAATATTACATCTGAAAAAGCTACAAGTATTTGACAAAAATTTAAGCTAGAATACATTTTAATAATTTATGCACACAAAACAAACAGAATTTATTTATTATTATTCTTCAACCCATCCCCCCAAAAAAAGATCTCGTATAAAGCAAAACGACAACTTTTACATTTAAAAGTGAAAAAATATCCATAAAAAAAAAACATTTATATTTAACAGTTCAGTTTCAAAGCATTCTCCTTAAAAATTCTCAAAAAAAAAAAAATCAAAGCAAAAATAATAATAAATAAACCGAACTTATATCAAAATAGAAACAAGACAAATTCGCATATCGTTTCAGTTTTTAAGTTGCTTACATTTAAAATTATTAAAAAAAGAAAAACAAATGTAAATAGAGCAGCGACAACAAAAAACCAGAACAACATGATCTAAGCGTATTTAATGTATTAAAAAACAAAACAAAAAAAGCTAAAAAACAATGTGAACATAAAAACTATGCAAGCAAGTGAAAAAATAGAACCATGAATGTGATCTATTTAATAATAAACAACAAAAAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAGAAATTTGACACGTTTGATTTTTTTTTCTTAAATCATAATACTAAAGTATTGCATAAATAAATGTAAACCTTTTAATTTGTAGAACTTAAAATATAATTTGCCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:37 ms:S:1056 AS:S:1056 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:S:345 s1:S:1096 s2:C:0 de:f:0.0053 rl:C:167
SRR6840922.8856616scaffold_91432916013S71M1D716M*00TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTGTTGAAATTGGAGTTTGTCGTGTTGTTTGCATTATTTTAAACGTTTGCAAACTGTTTCTTTTTTTTTTTGAGAGGCGGAAGTCGCCAAGACGCTAAGCTCAGCTGTTGCATGTTGCAAGTGGCATGTGGCGTGTGTGTTGAAACCCGGTTATTAAATTAAGCGATTCACTGGGCGGCCAGCGGCATATTTATTTTTGCCAGTGTCAAGTTTCCCCAATTAAATGTATTTTTATTTGTTTTTGTTTCCAATTACAATTTGCACAACTTCAATTAAGTCGTTTGTGCTGTGAACTAAACGAGTAAGGAAATTGTTATCAAGCTGTATTTCCCTTTTGGACTAGCACCAATATGGACCAGCCTCGTAATTGAATCAAATTATAATCTGCACTTGACCATCATTTTAGCCAATCACTTTGTATTTCAATACCCTTGCAGAGGATACAATAATTGCAGGAGACGATTCCCACCAGATTAGATTAGATTAGGAAGATAAGTCCCATAAGACCAGTCGTTCGAAAGATTAATTCTTATATGAAAAACGTTTTTGTGTAAGAAGACATTCTGAAAAAACTCAACAGTAATGTGTGTTATTATCGAATGTTTGACATCGGATTAACATATCGGATACGTCTAATAGGAACAATGCTTAGCTAGCCGTTTCTTGTGGCTTACAATTGTTAAACGGCTACAAAATCTATCTATGCCTAGTATGAAATCTGCCCAAGTCACTGGCCTACTTTCAGTAAAACATGCGTCACACGTTTATCACCAGAT<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:2 ms:S:775 AS:S:775 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:S:267 s1:S:776 s2:S:644 de:f:0.0025 rl:C:42
SRR6840922.885050scaffold_182889860583M96S*00ACACATCAGTTTTGAATCGACTACCGAACAGTTAAAACAATGTATTCTCCCGTGCAATTTACGGCTCTTGCGCTGATTTTTGCCCAGTTGTTAGGCGCAATACATTGTGGAGTGTACGATAATACGGATAATTGGGTCATTACCGACAAATCGAAGAGTTTCCCCGAAAACGCTGTTCTCGGCGGCTTTGATCCGGAAGGCTATAGAAGTTTCGTGGGACGCGTCTTTTATGTCACCTCTGTTGTGCCAGCACGTATTAGAGCCGAGACTGCATATGTCACATTTAACACCGAATCAGTCGCTAGTTCAGCGACCGCCTACGGAATACTAGTTTCCAATGCAACCCTCAGCTATCAGTGGGTGCGCAGTTTTGATGGATTCTTGGAAGATAATGCCGTATGTGTTGGAACGAGCTCTTCCGACGAACGCGTTTATATCTGTCGGGCCAAAACTGACGGTGGATTGTTCATTGGCACATTGTATCTATCACAAAGGACATGCATCATCGGTTACGAGAATTTGCCCCTGAGAAAGTTCGAAAAATACGAGGTGCTGGTTCGAAAACACAAATCGATAGAGTCGATACCATTCGATAATCAAATTAATTGATAAGATTGCCTTATTAAATGCTTGAATGAGCTTCAATGAACATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:1 ms:S:578 AS:S:578 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:C:183 s1:S:575 s2:S:503 de:f:0.0017 rl:C:27
SRR6840922.885060scaffold_182889860583M99S*00ACACATCAGTTTTGAATCGACTACCGAACAGTTAAAACAATGTATTCTCCCGTGCAATTTACGGCTCTTGCGCTGATTTTTGCCCAGTTGTTAGGCGCAATACATTGTGGAGTGTACGATAATACGGATAATTGGGTCATTACCGACAAATCGAAGAGTTTCCCCGAAAACGCTGTTCTCGGCGGCTTTGATCCGGAAGGCTATAGAAGTTTCGTGGGACGCGTCTTTTATGTCACCTCTGTTGTGCCAGCACGTATTAGAGCCGAGACTGCATATGTCACATTTAACACCGAATCAGTCGCTAGTTCAGCGACCGCCTACGGAATACTAGTTTCCAATGCAACCCTCAGCTATCAGTGGGTGCGCAGTTTTGATGGATTCTTGGAAGATAATGCCGTATGTGTTGGAACGAGCTCTTCCGACGAACGCGTTTATATCTGTCGGGCCAAAACTGACGGTGGATTGTTCATTGGCACATTGTATCTATCACAAAGGACATGCATCATCGGTTACGAGAATTTGCCCCTGAGAAAGTTCGAAAAATACGAGGTGCTGGTTCGAAAACACAAATCGATAGAGTCGATACCATTCGATAATCAAATTAATTGATAAGATTGCCTTATTAAATGCTTGAATGAGCTTCAATGAACATTAATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:1 ms:S:578 AS:S:578 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:C:183 s1:S:575 s2:S:505 de:f:0.0017 rl:C:29
SRR6840922.885080scaffold_182890060581M100S*00ACATCAGTTTTGAATCGACTACCGAACAGTTAAAACAATGTATTCTCCCGTGCAATTTACGGCTCTTGCGCTGATTTTTGCCCAGTTGTTAGGCGCAATACATTGTGGAGTGTACGATAATACGGATAATTGGGTCATTACCGACAAATCGAAGAGTTTCCCCGAAAACGCTGTTCTCGGCGGCTTTGATCCGGAAGGCTATAGAAGTTTCGTGGGACGCGTCTTTTATGTCACCTCTGTTGTGCCAGCACGTATTAGAGCCGAGACTGCATATGTCACATTTAACACCGAATCAGTCGCTAGTTCAGCGACCGCCTACGGAATACTAGTTTCCAATGCAACCCTCAGCTATCAGTGGGTGCGCAGTTTTGATGGATTCTTGGAAGATAATGCCGTATGTGTTGGAACGAGCTCTTCCGACGAACGCGTTTATATCTGTCGGGCCAAAACTGACGGTGGATTGTTCATTGGCACATTGTATCTATCACAAAGGACATGCATCATCGGTTACGAGAATTTGCCCCTGAGAAAGTTCGAAAAATACGAGGTGCTGGTTCGAAAACACAAATCGATAGAGTCGATACCATTCGATAATCAAATTAATTGATAAGATTGCCTTATTAAATGCTTGAATGAGCTTCAATGAACATTAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:1 ms:S:576 AS:S:576 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:C:181 s1:S:571 s2:S:499 de:f:0.0017 rl:C:29
SRR6840922.885090scaffold_18289006029M1I552M151S*00ACATCAGTTTTGAATCGACTACCGAACAGTTTAAAACAATGTATTCTCCCGTGCAATTTACGGCTCTTGCGCTGATTTTTGCCCAGTTGTTAGGCGCAATACATTGTGGAGTGTACGATAATACGGATAATTGGGTCATTACCGACAAATCGAAGAGTTTCCCCGAAAACGCTGTTCTCGGCGGCTTTGATCCGGAAGGCTATAGAAGTTTCGTGGGACGCGTCTTTTATGTCACCTCTGTTGTGCCAGCACGTATTAGAGCCGAGACTGCATATGTCACATTTAACACCGAATCAGTCGCTAGTTCAGCGACCGCCTACGGAATACTAGTTTCCAATGCAACCCTCAGCTATCAGTGGGTGCGCAGTTTTGATGGATTCTTGGAAGATAATGCCGTATGTGTTGGAACGAGCTCTTCCGACGAACGCGTTTATATCTGTCGGGCCAAAACTGACGGTGGATTGTTCATTGGCACATTGTATCTATCACAAAGGACATGCATCATCGGTTACGAGAATTTGCCCCTGAGAAAGTTCGAAAAATACGAGATGCTGGTTCGAAAACACAAATCGATAGAGTCGATACCATTCGATAATCAAATTAATTGATAAGATTGCCTTATTAAATGCTTGAATGAGCTTCAATGAACATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:3 ms:S:564 AS:S:564 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:C:173 s1:S:564 s2:S:483 de:f:0.0052 rl:C:82
SRR6840922.885120scaffold_182890060581M92S*00ACATCAGTTTTGAATCGACTACCGAACAGTTAAAACAATGTATTCTCCCGTGCAATTTACGGCTCTTGCGCTGATTTTTGCCCAGTTGTTAGGCGCAATACATTGTGGAGTGTACGATAATACGGATAATTGGGTCATTACCGACAAATCGAAGAGTTTCCCCGAAAACGCTGTTCTCGGCGGCTTTGATCCGGAAGGCTATAGAAGTTTCGTGGGACGCGTCTTTTATGTCACCTCTGTTGTGCCAGCACGTATTAGAGCCGAGACTGCATATGTCACATTTAACACCGAATCAGTCGCTAGTTCAGCGACCGCCTACGGAATACTAGTTTCCAATGCAACCCTCAGCTATCAGTGGGTGCGCAGTTTTGATGGATTCTTGGAAGATAATGCCGTATGTGTTGGAACGAGCTCTTCCGACGAACGCGTTTATATCTGTCGGGCCAAAACTGACGGTGGATTGTTCATTGGCACATTGTATCTATCACAAAGGACATGCATCATCGGTTACGAGAATTTGCCCCTGAGAAAGTTCGAAAAATACGAGGTGCTGGTTCGAAAACACAAATCGATAGAGTCGATACCATTCGATAATCAAATTAATTGATAAGATTGCCTTATTAAATGCTTGAATGAGCTTCAATGAACATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<NM:C:1 ms:S:576 AS:S:576 nn:C:0 ts:A:+ tp:A:P cm:C:181 s1:S:571 s2:S:499 de:f:0.0017 rl:C:23

Iso-Seq Read Alignments (isoseq_bam) Track Description
 

Description

This track shows the alignments of D. grimshawi Iso-Seq reads against the D. grimshawi genome assembly (DgriCAF1) using Minimap2. The Iso-Seq data were obtained from the NCBI Sequence Read Archive under the accession number SRP135764.

References

Yang H, Jaime M, Polihronakis M, et al. Re-annotation of eight Drosophila genomes. Life Sci Alliance. 2018;1(6):e201800156. Published 2018 Dec 24. doi:10.26508/lsa.201800156

Li H. Minimap2: pairwise alignment for nucleotide sequences. Bioinformatics. 2018;34(18):3094-3100. doi:10.1093/bioinformatics/bty191